选择离子交换树脂的一般原则是选择交换容量大、容易再生，而且使用耐久的树脂。具体来说:
(1) 交换容量是离子交换离子树脂性能的一个重要指标，交换容量越大则同体积的树脂能吸附的离子越多，一个交换周期的制水量也越大。一般来说，弱酸或弱碱性树脂比强酸或强碱性的树脂交换容量大。另外，在同类树脂中，由于树脂的交联度不同，交换容量也不同。一般交联度小的树脂交换容量大；交联度大的树脂交换容量小。因此在选择树脂时要注意。
(2) 要根据原水中需要去除离子的性质来选择树脂。如果只需要去除水中交换吸附性弱的离一子时，则必须选用强酸或强碱性树脂。
(3) 要根据出水水质要求来选择树脂。如果只需要部分除盐的系统，可以选用强酸性阳树脂和弱碱性阴树脂配合使用。对于必须完全除盐的纯水或高纯水系统，则要选择吸附性强的强酸性阳离子交换树脂和强碱性阴离子交换树脂配合使用，以去除转难吸附的离子。
(4) 要根据原水中杂质的成分来选择离子树脂装置。如原水中有机物较多，或去除离子的半径较大时，应选用交联网孔直径较大的树脂。尽量选择高强度多孔性树脂。
(5) 用于混合床的树脂，较多的是强酸一强碱性树脂的组合。但是要考虑混合床树脂再生时分层容易，因此，要求两种树脂的湿真密度之差应大一些，一般应不小于15%一20%。另外，还要考虑到混合床运行时交换流速比较大，树脂磨损较为严重的情况下，故应选择耐磨性的离子树脂设备。
要根据除盐水工艺要求来选择树脂。例如双室床，选用强、弱性树脂配合使用，因为弱性树脂容易再生，对再生剂的质量要求也比较低，可以利用强性树脂再生后的再生液来再生弱性树脂，这样，再生剂的消耗低，制水成本低。
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