扎伊尔埃博拉病毒染料法荧光定量RT-PCR试剂盒

来源:网络  作者:网络转载   2019-10-09 阅读:270

 

产品及特点

扎伊尔埃博拉病毒(Zaire Ebola Virus,ZEBO)是一种RNA病毒,是一种能引起人类和其他灵长类动物产生埃博拉出血热的烈性传染病病毒,其引起的埃博拉出血热是当今世界上最致命的病毒性出血热,感染者症状与同为纤维病毒科马尔堡病毒极为相似,包括恶心、呕吐、腹泻、肤色改变、全身酸痛、体内出血、体外出血、发烧等。死亡率在50%至90%之间,致死原因主要为中风心肌梗塞低血容量休克或多发性器官衰竭,因此快速准确鉴定对该病的预防和检疫有着重要作用。本产品基于PCR原理开发。它具有下列特点:

  • 一站式,用于不需要单独准备每种成分,包括引物和对照。
  • 根据扎伊尔埃博拉病毒的保守基因序列设计的引物,具有良好的特异性。
  • 基于染料法qRT-PCR检测,灵敏度比常规RT-PCR高10-100倍,可以达到至少1000拷贝/反应。
  • 使用一管式qRT-PCR技术RT和PCR两步在一个试管内完成不需要中间转移样品,降低了操作误差和可能的污染
  • 产品足够50次30μL体系的RT-PCR只能用于科研,不能用于临床

 

规格及成分

成  份

编号

十孔包装

2×qRT-PCR 缓冲液

190101a

500 μL(棕色管)

10×qRT-PCR酶混合液

190101b

100 μL(红盖)

 ROX染料I

190101c

50 μL(棕色管)

ROX染料II

190101d

50 μL(棕色管)

荧光PCR专用模板稀释液

180701

1mL(亮黄盖)

扎伊尔埃博拉病毒RT-PCR引物混合液

14-30050yw

100 μL(白盖)

扎伊尔埃博拉病毒RT-PCR阳性对照

(1×10E8拷贝/μL

14-30050pc

50 μL(黄盖)

天净沙核酸释放剂试用装

61202

20次(1mL,绿盖)

使用手册

14-30050sc

1份

 

 

运输及保存

低温运输,-20℃保存,保存期限为12个月。阳性对照需要因易污染其他成分需要单独放置。本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供RNA段作为阳性对照。

 

自备试剂

样品RNA

 

使用方法

一、稀释阳性对照(以10E2-10E7这6个10倍稀释度为例。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原。

  • 标记6个离心管,分别为7,6,5,4,3,2。用带芯枪头分别加入45 μL 荧光PCR专用模板稀释液,用带芯枪头,下同)
  • 7号管中加入5 μL 10E8拷贝/μL 的阳性对照(本试剂盒提供),充分震荡1分钟,得10E7拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。
  • 换枪头,在6号管中加入5 μL 10E7拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得10E6拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。
  • 换枪头,在5号管中加入5 μL 10E6拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得10E5拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。重复上面的操作直到得到6个稀释度的阳性对照。放冰上待用。

二、样品RNA的制备

  • 如果有N个样品,必须设置N+2个提取,多出的一个是PC(样品制备阳性对照)一个是NC样品制备阴性对照)。可以用10μL上步制备阳性对照梯度稀释液中的4浓度为1×10E4拷贝/μL,10μL相当于1万拷贝加上一定量的水作为制备的阳性对照(加水后其总体积跟样品一样,样品体积多少取决于所用试剂盒的要求)。可以用水作为制备的阴性对照。
  • 用自选方法纯化N+2样品的RNA,本试剂盒跟市场上大多数病毒RNA提取试剂盒兼容。本试剂盒免费赠20次免RNA提取的天净沙核酸释放剂试用装

三、设置RT-PCR反应(20μL体系,在样品制备室进行

  • 如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个PCR管,其中N+2个于上步得到的N+2个样品1个用于PCR阴性对照,6个用标准曲线。如果做定性分析,并且只做1次重复,则标记N+4个PCR管,其中N+2个于上步得到的N+2个样品1个用于PCR阴性对照(用水做模板),1个用于PCR性对照(用第4号阳性对照稀释液做模板)下面只描述定量分析的步骤,定性分析只是把6个标曲反应缩减成1个,其余不变。
  • 标记管中下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,阳性对照样品要等所有管子盖子后最后加):

成分

N+2制备所得样品

RT-PCR阴性对照

RT-PCR阳性

对照(2-7管)

2×qRT-PCR 缓冲液

10μL

10μL

各10μL

口蹄疫RT-PCR

引物混合物

2μL

2μL

2μL

50×ROX (见注)

0.4μL

0.4μL

各0.4μL

 样品制备所得RNA模板(来于8

5.6μL

不加

不加

稀释所得6个阳性对照(来于第6步)

不加

不加

5.6μL(2号样到2号管,3号样到3号管

10×qRT-PCR

酶混合液

2μL

2μL

2μL

注:需使用ROX染料I的机型:ABI Prism7000、7300、7700、7900HT、Step-One、Step-One Plus

需使用ROX染料II的机型::ABI Prism 7500、7500Fast、MJ Research的Chromo4Opticon(II)Corbett Rotor Gene 3000

需要使用ROX的机型:Thermal Cycle Dice Real Time System, LightCycler、Smart Cycler SystemAgilent Mx3000P、RotorGene 3000、RotorGene 6000。

  • 上机后按下面参数进行RT-PCR(参数可能会因仪器不同而需优化)。

过程

温度

时间

RT逆转录

50℃

15-30分钟

预变性

94℃

2分钟

RT - PCR反应

30个循环)

95℃

15 秒

60

15 秒(采集FAM通道的荧光信号

72

15 秒

仪器预设程序进行溶解曲线分析

  • 数据处理
  • 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品RNA浓度的log值,推算出其浓度
  • 如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照Ct必须大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于或等于30。对待测样品,如果其Ct大于或等于40则为阴性,如果小于或等于35则为阳性。如果在35-40之间,则重复一次。重复实验的Ct值如果大于或等于40则为阴性,如果小于40,则为阳性。

 

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扎伊尔埃博拉病毒可视化RT-LAMP检测试剂盒

标签: 扎伊尔
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