智能集菌仪一体化不锈钢机壳设计，全部采用L304卫生级不锈钢，提高仪器的使用寿命，降低因传统集菌仪表面生锈问题造成的维修、更换等产生的成本。
集菌仪的正确使用方法：
(1)取出培育器先检查包装是否完好无损，在无菌室内翻开塑料包装袋。
(2)将培育器逐一插放在不锈钢座上。
(3)将集菌培育器的弹性软管装入智能集菌仪泵头，要求定位准确，软管走势顺利。
(4)翻开待检样品的瓶盖插针孔并消毒之，(若检测安瓿样品，先将安瓿颈部消毒，然后翻开并将安瓿)样品瓶定位。
(5)拔去进样双芯针管之护套，插入样品瓶中，敞开集菌仪，施行过滤集菌(应防止双芯针管进气，滤膜被药液浸湿，影响进气)。
(6)完结集菌后，若样品含抑菌物质，按药典 规范要求适当用冲洗液清洗，清洗方法与集菌过程相同。
(7)消毒培育基瓶插针孔处。
(8)摘下顶部空气滤器开口的胶塞，套在培育器底口上，用软管夹子，顺次开闭软管，敞开集菌仪，将培育基泵入指定的培育器内。
(9)用夹片夹闭与培育器衔接部的软管，留下5～6cm软管，剪除其余部分，并将开口端插在空气过滤器开口上。
(10)别离按规则进行培育。
(11)调查培育状况，若需取样别离培育，可将软管消毒，用无菌注。
集菌仪原理是通过智能集菌仪定向蠕动加压，使供试品中微生物截留在滤器中的微孔滤膜（0.22m*47mm或0.45m*47mm上，通过冲洗滤膜除去抑菌成分；
然后把所需的培养基通过进样管道直接引入全封闭过滤集菌培养器中，放置在培养箱内进行无菌培养。
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