1、电磁流量计目前不能用来测量电导率很低的液体介质，如对石油制品或有机溶剂等介质的流量。
2、电磁流量计目前不能用来测量气体、蒸汽以及含有大量气体的液体流量。
3、电磁流量计安装和调试要求严格。
（1）电磁流量计传感器和转换器必须一一对应，不同型号产品之间不能互换使用。
（2）电磁流量计安装必须符合安装规范。
4、电磁流量计测量脏污或粘稠介质时，介质会附着在内壁或电极上（刮刀式电极可以清除覆盖在电极上的污垢），电磁流量计随污物厚度增加而带来误差，甚至不能正常工作。
5、电磁流量计内孔径因结垢或磨损，会改变流量计原定流量值，造成测量误差。
6、电磁流量计提高测量精度和抗干扰能力，需要选用高性能转换器，成本增加较多。
7、电磁流量计容易受外部强电磁信号干
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