CNC加工中心换刀的指令是M06指令，从刀库调用一把新刀安装在主轴上，车床并把主轴上原来的旧刀还回刀库。执行M06指令后，刀具将被自动地安装在主轴上。加工中心M06为非模态后作用M功能。在执行M06指令前，一定要用G28指令让机床返回参考点，并且取消一切补偿，这是因为有增量式位置检测元件的Z轴，为了保证换刀时主轴准停功能的可靠性，必须让机床返回参考点，否则换刀动作可能无法完成。
在通常情况下，CNC加工中心换刀功能出现故障的原因主要有：某个输入或输出信号不对，出现短路、断路，位置检测不到位，刀库乱刀，数刀计数器出错，继电器损坏；由于与之有的液压、气压系统，机械卡死、松脱等影响。但是有那么一些故障很少遇见，特别在资料不祥无提示，故障点隐蔽，报警信息少，甚至无报警情况下，需要仔细认真的去观察分析。
在自动加工方式下，每当执行换刀语句（M06）时，突然跳到下面的插补语句，不换刀而直接以原来的刀具加工。同时，后面刀库中刀具仍然在预选过程中。无任何报警信息。在通常情况下，不能换刀或者不能执行换刀语句的问题是很常见的，此例中，后面的自动刀库中刀具仍然在预选过程中，而且已经在利用原来的刀具加工。
为了确保人身和设备和安全，必须即时停机。为了进一步查找原因，在MDI方式下单独执行换刀语句（如：“T2；M06”），刀具能够交换。由此确定不是执行机构本身的问题。是否系统操作不规范、电源电压波动大或其它外界干扰因素，导致系统偶然出现紊乱。重新启动运行，故障依旧。在MDI方式下，执行换刀和插补语句连贯时（如：“T2；M06；G01X200.0Y150.0；M30；”试运行的现象与自动方式下完全一样。决定进一步查看PMCPRM参数两面中的定时器（TIMER）、计数器（COUNTER）、数据表（DATA）、保持继电器（KEEPRL），厂家没有完整的提供标准参数和具体对照含义，本工段有一完全相同的该型加工中心，将两设备设置到相同的模式下，以正常的参数作为参考标准一一排除，发现KEEPRL中K03#1=1；而正常的K03#1=0；该类数据通常作为定义或支持某个功能的实现。在确保即时停机的情况下，修改该位为“0”，试运行。机床恢复正常。
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