钼矿选矿设备在磨矿阶段常用球磨机或棒磨顶进入球磨流程。浮选采用优先浮选法。精选产出钼粗精矿，粗扫选尾矿回收伴生矿物或丢弃。钼粗精矿采用两、三段再磨，四、五次精选获得最终钼精矿。
钼矿的浮选药剂以非极性油类做捕收剂，同时添加起泡剂。美国和加拿大表面活性剂辛泰克斯作油类乳化剂。根据矿石性质，用石灰做调整剂，水玻璃作脉石抑制剂，有时加氰化物或硫化物抑制其他重金属矿物。
为保证钼精矿质量，对钼精矿中所含的铜、铅、铁等重金属矿物和氧化钙以及炭质矿物需要进一步进行分离。
一般使用硫化钠或硫氢化钠，氰化物或铁氰化物制铜和铁；用重铬酸盐或诺克斯抑制铅。如果使用抑制剂，杂质含量还打不到质量标准，尚需辅化化学选矿处理：次生硫化铜用氰化物浸出；黄铜矿用三氯化铁溶液浸出；方铅矿用盐酸和三氯化铁溶液浸出，均可达到标准含量。
含氧化钙的脉石易泥化，因此，对于含此类脉石的矿石切忌过磨。生产上往往添加水玻璃，六聚偏磷酸钠或有机胶作脉石抑制剂或分散剂；也可用活性炭加CMC抑制碳酸盐脉石。最终可用盐酸或盐酸加三氯化铁溶液浸出处理。
含炭质矿物的分离，首先要查明炭质是属石墨类、沥青类或煤类。这些炭质矿物的可浮性与辉钼矿相近，但密度较小，一般可用重选法进行脱除；使用六聚偏磷 酸钠和CMC抑炭浮钼；或加三氯化铁、水玻璃和六聚偏磷酸钠抑制炭质也有效；采用焙烧除去有机碳，也是方法之一。应该指出的是，所有这些炭质矿物的分离方法，目前还不能令人满意，还是一个尚未完全解决的问题。
脉石中SiO2含量太高，常常是影响钼精矿品位的原因。经查定：SiO2含量随着钼精矿品位提高而下降，两者有相互消费的趋势。只要钼矿物达到单体解 离细度，SiO2含量一般可降到标准以下。加活性炭吸附钼表面的油药，再加CMC抑制硅酸盐脉石，SiO2含量也可降到标准以下。
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