叶片的Pn受内部生理因素如生育期、叶龄、不同部位叶片的影响，还受到环境因素光、温、水、CO2、风速等的影响。因此，要正确的比较处理间的光合差异，掌握测试方法是非常重要的。
1)选择同样生育期、相同叶龄、部位的叶片进行比较。如光合作用对产量的影响会随作物生育期不同而不同，因此，据研究目的首先应确定测试的时期。对大量的基因型进行测定时，要在做好生育期调查记载的同时，按生育进程分组、分批测定，同时在测试时有目的地选择一些有代表性的植株，使试材间生育期不同造成的影响在一定程度上降到低。
2)测试叶位的选择。对于品种、处理间的比较，一般选择对产量影响大、光合速率高的叶片，如小麦、水稻为旗叶，玉米为棒三叶(以穗上叶为zui好，其叶片倾角受穗大小的影响较小)，棉花打顶前为倒5展叶，打顶后为倒一展叶。
3)测定时期的选择。根据不同的研究目的选择适宜的测定时期非常重要，这样可避免盲目测定，尽量减少测定次数而达到zui佳效果。因此，有必要先了解研究对象作物光合的大致特性。如小麦、玉米、水稻等作物单叶大光合一般出现在叶片展开至展开后的几天，玉米群体光合zui大值出现在抽雄至吐丝期，棉花出现在盛花至盛铃期。
4)测定时间的选择。Ｃ3作物如小麦、棉花等大都有明显的光合"午休"现象，其一日内光合大值一般出现在上午的9：30一11：30(当地时，下同)，午休出现在12:00一14:00。因此，对一批材料的测试可在9:30一11:30前后测完，或在9:30一11:30测完重复，在12:00一14:00测完第二重复，在15:00一16:30测完第三重复。玉米等Ｃ4作物不表现"午休"现象，Pnzui高值出现在中午，因此可在11:00一14:00时光强较稳定时测定。对大量材料采用轮回测定的方法，并熟练掌握操作技术，以缩短整个测试过程。并通过调节叶室向光方向，使一批样能在相对统一的光强下完成测定，以避免不同材料由于入射PAR差异而产生误差。
5)供试材料的准备。(1)在测定之前不要让供试材料遭受急剧的环境变化。特别是冬季，温室栽培植物不要直接搬到屋外低温环境条件下。(2)带入室内的供试材料尽可能放在明亮的地方，当长时间放在照度低的地方时，由于气孔完全关闭，测定开始后到出现光合速率大值要花费较多时间。(3)用离体叶测定时，要用刀片在水中剪断，输导组织内的水不要断开。(4)选生长健康、代表性强的植株为试材。此外，由于源库具一定的互作关系，应该在确定库容量、授精或者输导过程无异常的情况下进行测定。
6)测定呼吸速率时用两层黑布罩在叶室上，待CO2稳定释放后采样。
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