聚合物基质色谱柱具有相当强的硬度，有无孔和有孔两种规格。该固定相中含有苯基官能团，可与待测物发生疏水相互作用。与硅胶基质的反相填料相比，PolyRP固定相的一个显著优点是可以在极端pH（1-14）条件下使用，尽管分离效率略有降低。它具有相当强的硬度，有无孔和有孔两种规格。该固定相中含有苯基官能团，可与待测物发生疏水相互作用。与硅胶基质的反相填料相比，PolyRP固定相的一个显著优点是可以在极端pH（1-14）条件下使用，尽管分离效率略有降低。
聚合物基质色谱柱的安装：
a、拆开柱包装盒，确认色谱柱的类型、尺寸、出厂日期以及柱内贮存的溶剂。
b、拧下柱两端接头的密封堵头放回包装盒供备用。
c、按柱管上标示的流动相流向，将聚合物基质色谱柱的入口端通过连接管与进样阀出口相连接(如条件允许，建议在柱前使用保护柱)；柱的出口与检测器连接。连接管是外径为1.57mm、内径为0.1-0.3mm的不锈钢管。在接管时一定要设法降低柱外死体积。连接管通过空心螺钉、压环后尽量用力插到底，然后顺时针拧紧空心螺钉，直到拧不动为止，切记不要用力过大。如聚合物基质色谱柱通过流动相加压后有漏液现象，请用扳手继续顺时针拧1／4圈，直至不漏液为止。
聚合物基质色谱柱主要基质的特点：
a.硅胶
硅胶是陶瓷性质的无机物基质，刚性大，不易变形。
化学性质较稳定，但对于水溶液尤其碱性水溶液仍然是不稳定的，即使表面经过良好的化学键合，覆盖了固定液，还是要注意水、碱性溶液、酸性溶液对硅胶的溶解作用，基质或者说是柱床(packedbed)溶解对色谱柱的影响是致命的。
以聚合物基质色谱柱的填料构成了目前绝大多数的色谱柱填料。纯硅胶填料适宜分离溶于有机溶剂的极性、弱极性的非强离解型的化合物，硅胶也可以做凝胶色谱但柱效较低。
聚合物基质色谱柱键合固定相的高压液相填料，有其他填料无法比拟的高分离效能。
b.二氧化铝
二氧化铝和硅胶相似，但对水溶液、酸性碱性水溶液溶液更加不稳定。所以，极少用作键合固定相的基质，也是适宜分离溶于有机溶剂的极性、弱极性的非强离解型的化合物，尤其是分离芳香族碳氢化合物。酸性易离解的化合物容易在二氧化铝上形成死吸附。另外，氧化铝分离几何异构体能力优于硅胶。
c.聚合物填料
聚合物基质色谱柱受压会变形，压力限度低但pH使用范围宽。苯乙烯-二乙烯苯基质疏水性强，使用任何流动相，在整个pH范围内稳定，可以用强酸、强碱来清洗色谱柱。甲基丙烯酸酯基质比苯乙烯-二乙烯苯疏水性更强，但可以通过适当的功能基修饰变成亲水性的。
由于不耐压、有溶胀性，所以聚合物填料适宜用于大分子像蛋白质或合成的高聚物，另外还可以制成分子排阻、离子交换柱。大孔树脂实际上主体就是苯乙烯-二乙烯苯聚合物或类似的合成高聚物。
聚合物基质色谱柱广泛用于各种不同基质中糖分子、糖醇和其他水溶性物质的分离。可以用来分析有机酸及利巴韦林等物质，可以用来分离树胶醛糖、阿糖醇等糖类。
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